مرکز آزمون الکترونیک دانشگاه فعالیت خود را از سال ۱۳۹۸ آغاز نموده است. سالن شماره یک این مرکز در سال 1398 و سالن شماره دو در سال 1400 افتتاح شد.در حال حاضر این مرکز، برگزاری آزمونهای درون دانشگاهی دانشجویان ایرانی و بین الملل ۱۲ دانشکده و واحد دانشگاه در قالب ۸۰ گروه آموزشی را بر عهده دارد. به علاوه این مرکز، خدمت رسانی جهت برگزاری آزمونهای ملی و وزارتی را نیز بر عهده دارد. این مرکز با متراژ ۱۳۰۰ متر مربع و دارا بودن ۲ سالن و ۴۲۰ سیستم، به طور میانگین روزانه ۸ آزمون و تعداد ۶۵۰ نفر داوطلب روزانه در ۷ روز هفته، برای مجموعه دانشگاه علوم پزشکی ایران و وزارت بهداشت برگزار می نماید.